У голосеменных растений, в отличие от папоротников, не происходит размножение спорами. Голосеменные растения, к которым относятся сосны, ели, кедры и другие, размножаются с помощью семян, а не спор, как это происходит у папоротников. У папоротников же споры формируются на нижней стороне листьев (спорофиллов), и когда они созревают, они высвобождаются в окружающую среду для дальнейшего развития в новые растения.
Развитие зародыша из зиготы, образование гамет и оплодотворение происходят как у голосеменных, так и у папоротников, хотя и с некоторыми отличиями в деталях процессов. Например, у голосеменных оплодотворение происходит внутри семязачатка, что ведет к формированию семян, содержащих защищенный зародыш, в то время как у папоротников процесс оплодотворения происходит обычно в водной среде, где мужские гаметы должны плыть к женским гаметам для осуществления оплодотворения.